Una breve explicación de mis publicaciones (so far)

  1. Domínguez-Hüttinger, P. Christodoulides, K. Miyauchi, A. D. Irvine, M. Okada-Hatakeyama, M. Kubo, and R. J. Tanaka.  2017. “Mathematical Modeling of Atopic Dermatitis Reveals ‘Double switch’ Mechanisms Underlying Four Common Disease Phenotypes,” J. Allergy Clin. Immunol  139:1861-72

Pueden encontrar el PDF aquí: JACI_2017_DominguezHuttinger_etal

El modelo matemático (ecuaciones diferenciales ordinarias con dos escalas temporales) planteado en este artículo propone una explicación de los mecanismos que desencadenan el inicio y la progresión de la dermatitis atópica, así como del funcionamiento de tratamientos preventivos. Lo novedoso de este modelo es que logra integrar en un marco formal, coherente  y dinámico una gran cantidad de observaciones experimentales y clínicas que anteriormente se creían incompatibles.

 

Esta publicación fue comentada en artículos que aparecieron en el Journal of Allergy and Clinical Immunology (Bending_and_Ono_JACI_2017), en la gaceta de la National Eczema Society (NationalEczemaSociety), en la Gaceta UNAM (Gaceta_UNAM_Our_paper_only),  y en la Prensa (unamirada_613), entre otros que no incluyo por que están en japonés.

2. Christodoulides, Y. Hirata, E. Domínguez-Hüttinger, S. G. Danby, M. J. Cork, K. Aihara, and R. J. Tanaka. 2017. “Computational design of treatment strategies for proactive therapy on atopic dermatitis using optimal control theory,” Phil.Trans.R. Soc. A., 375: 20160285.

 

Pueden encontrar el PDF aquí: Phil_Trans_A_Christodoulides_2017

Aquí utilizamos el modelo matemático propuesto en la publicación anterior para encontrar mejores (que minimicen los efectos secundarios negativos) estrategias de tratamiento para casos de dermatitis atópica avanzada, utilizando algoritmos de teoría de control óptimo.

 

  1. Domínguez-Hüttinger, N. J. Boon, T. B. Clarke, and R. J. Tanaka, 2017. “Mathematical modelling of colonization, invasive infection and treatment of Streptococcus pneumoniae,” Front. Physiol., 8:115

Pueden encontrar el PDF aquí: Frontiers_2017_DominguezHuttinger_etal

En este artículo proponemos un modelo matemático (ecuaciones diferenciales ordinarias con dos escalas temporales) que explica bajo qué condiciones la bacteria comensal Streptococcus pneumoniae se vuelve patogénica. Utilizamos este modelo para diseñar tratamientos óptimos (es decir, con dosis mínimas) para prevenir o para revertir infecciones por esta bacteria. Esto último es importante en clínica, puesto que el aumento en cepas bacterianas resistentes a antibióticos se adjudica al uso excesivo de antibióticos.

 

  1. F. Méndez-López, J. Dávila-Velderrain, E. Domínguez-Hüttinger, C. Enríquez-Olguín, J. Martínez-García, and E. R. Álvarez-Buylla. 2017. “Gene regulatory network underlying the immortalization of epithelial cells”. BMC Syst. Biol., 11(24), pp.1–15.

Pueden encontrar el PDF aquí: BMC_Systems_Biology_2017_MendezLopez

En este artículo proponemos un modelo matemático discreto (red booleana) que reproduce las transformaciones típicas de células epiteliales que se vuelven cancerosas.

 

  1. D. A. van Logtestijn, E. Domínguez-Hüttinger, G. N. Stamatas and R. J. Tanaka. 2015. Resistance to water diffusion in the stratum corneum is depth-dependent. PLoS ONE 10(2):e0117292. http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0117292

Pueden encontrar el PDF aquí: van Logtestijn et al. – 2015 – Resistance to Water Diffusion in the Stratum Corneum Is Depth-Dependent

Se propone y valida con datos experimentales un modelo matemático (ecuaciones diferenciales por compartimentos) que reproduce la heterogeneidad espacial de la permeabilidad de la barrera epidérmica.

 

  1. Domínguez-Hüttinger E., M. Ono, M. Barahona and R.J. Tanaka. 2013. Risk factor-dependent dynamics of atopic dermatitis: modelling multi-scale regulation of epithelium homeostasis. Interface Focus 3:20120090 http://rsfs.royalsocietypublishing.org/content/3/2/20120090

Pueden encontrar el PDF aquí: Interface Focus-2013-Domínguez-Hüttinger-

En este artículo se propone una primera versión del modelo descrito en la publicación 1.

 

  1. Tecalco-Cruz, A., M. Sosa-Garrocho, G. Vázquez-Victorio, L. Ortiz-García, Domínguez-Hüttinger E. y and M. Macías-Silva. 2012. Transforming growth factor-beta/SMAD target gene skil is negatively regulated by the transcriptional cofactor complex SNON/SMAD4. The Journal of Biological Chemistry 287(32): 26764-26776 http://www.jbc.org/content/287/32/26764.long

Pueden encontrar el PDF aquí: J. Biol. Chem.-2012-Tecalco-Cruz-26764-76

En este artículo se describe, experimentalmente, un asa de retroalimentación negativa que regula la respuesta de las células a un factor micro-ambiental llamado TGF-beta.

Autor: Dra. Elisa Domínguez Hüttinger elisa.dominguez@iibiomedicas.unam.mx

Como bióloga de sistemas, me apasiona utilizar y desarrollar herramientas teóricas para entender los mecanismos de cambio en los sistemas biológicos. Específicamente, me interesa entender los procesos patológicos que subyacen la emergencia y empeoramiento gradual de enfermedades complejas, como la dermatitis atópica, el asma, y el cáncer. Desarrollo modelos dinámicos de estas enfermedades, con el fin de analizar las diferentes fases de que describen la transición entre un organismo sano y uno enfermo. Esta nueva perspectiva es útil para proponer nuevas estrategias de prevención y tratamiento que minimicen el uso de fármacos y maximicen la calidad de vida. Además, las herramientas teóricas que desarrollamos nos permiten integrar y analizar diversos datos experimentales y clínicos, con el fin de extraer más y mejor información de estos datos, planear nuevos experimentos, y optimizar el uso de recursos experimentales y económicos. Por ello, creo que la biología de sistemas debe ser un área prioritaria en países como México y el resto de América Latina, en donde la escasez de recursos para la ciencia y la tecnología limitan el avance científico y tecnológico. Estudié la licenciatura en biología y un poco de matemáticas en la Facultad de Ciencias de la UNAM, y realicé mi maestría, doctorado y primer posdoctorado en el Departamento de Bio-ingeniería del Imperial College London, Reino Unido, en el laboratorio de la Dra. Reiko J. Tanaka (http://www.bg.ic.ac.uk/research/r.tanaka/welcome.html/Welcome.html), co-asesorada por el Prof. Mauricio Barahona (Departamento de Matemáticas, Imperial College London http://www.imperial.ac.uk/people/m.barahona). Realicé estancias de investigación en la el laboratorio del Dr. Alejandro Colman-Lerner en la Universidad de Buenos Aires, Argentina (http://www.ifibyne.fcen.uba.ar/new/temas-de-investigacion/laboratorio-de-fisiologia-y-biologia-molecular-lfbm/biologia-de-sistemas/dr-alejandro-colman-lerner/), en el laboratorio de la Dra. Mariko Okada-Hatakeyama en el RIKEN Institute of Integrative Medial Sciences, en Yokohama, Japón (http://csb.gsc.riken.jp/w/), y en el Centro de Ciencias de la Complejidad y el Instituto de Ecología de la UNAM (lab de Elena Álvarez-Buylla). Actualmente trabajo como Investigadora en Biología Matemática en el Centro de Ciencias Matemáticas UNAM - campus Morelia. Contacto elisa @ matmor.unam.mx

3 opiniones en “Una breve explicación de mis publicaciones (so far)”

  1. Buen día Dra. Domínguez:

    Buscando sobre biología matemática en México, me encontré con su blog. Estoy muy interesado en realizar mi tesis sobre matemáticas aplicadas en redes metabólicas.

    Lamentablemente, en la U de G (en donde yo estudio), nadie trabaja en dicha área y la biología matemática es casi inexistente en mi departamento, por lo cual me atrevo a escribir este correo para pedirle sugerencias bibliográficas o cualquier otro tipo de recomendación que usted me pueda brindar.

    Saludos!

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    1. Hola Oscar,

      Gracias por tu interés; si quiers mejor escríbeme a mi correo, es más fácil comunicarnos por ahí (elisa.dominguez arroba mail.ecologia.unam.mx).

      Así de rápido te sugiero que cheques la bibliografía de un curso que vamos a dar este semestre, encuentras la info acá:

      http://www.fciencias.unam.mx/docencia/horarios/presentacion/286660

      Sobre modelos de redes metabólicas, te sugiero que contactes al Dr. Osbaldo Resendis Antonio (http://www.inmegen.gob.mx/es/investigacion/investigadores/curriculum-vitae/?perfil=2149) del INMEGEN; él es experto en modelaje de redes metabólicas.

      Hace unos meses visité la UdeG; creo que hay bastantes personas intersadas en hacer biología Matemática; puedes contactar al Dr. ALonso Castillo Ramirez, quien es algebrista de la UdeG, pero conoce a los Biomatemáticos; me parece que son del departamento de Control de CUCEI.

      Saludos cordiales
      Elisa

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  2. Pingback: Materia de intro a la bio de sistemas – Biología de sistemas – México

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